Juan Camilio Mouriño nació en Madrid, hijo de Carlos Mouriño Atanes —empresario español dueño del Real Club Celta de Vigo— y Ángeles Terrazo, mexicana por nacimiento pero hija de padres originarios de la localidad de Avión, Orense;[3] tenía por tanto de nacimiento las nacionalidades española y mexicana, esta última de acuerdo con el artículo 30, inciso A, fracción II de la Constitución,[4] debiendo elegir una de las dos al cumplir 18 años de edad, eligió la nacionalidad mexicana.[5] Aún así, su nombramiento está en entredicho, ya que en 1996, el diario El Sur con sede en Campeche, dio a conocer que Mouriño ingresó a territorio mexicano con el pasaporte español número: 8800581, expedido por el Ministerio de Relaciones Exteriores de España[6] y de comprobarse, Mouriño perdería la nacionalidad mexicana por naturalización conforme al artículo 37, inciso B, fracción I de la Constitución[4] , además de estar incurriendo en el delito de ejercicio indebido de servicio público. [7]
Es Licenciado en Economía egresado de la Universidad de Tampa, Florida y Maestro en Contaduría con especialidad en Finanzas por la Universidad Autónoma de Campeche. A mediados de la década de los 90's fue secuestrado y posteriormente ingresó a la actividad política, donde ha ocupado los cargos de Diputado al Congreso de Campeche en representación del V Distrito Electoral Local de Campeche, Diputado federal plurinominal a la LVIII Legislatura de 2000 a 2003, candidato a Presidente Municipal de Campeche en las Elecciones de 2003, en las que no obtuvo el triunfo, que correspondió al priista Fernando Ortega Bernés.
Designado Coordinador General de Asesoría y Enlace Institucional de la Secretaría de Energía; al ser nombrado titular de la misma Felipe Calderón Hinojosa, Mouriño fue nombrado Subsecretario de Electricidad, cargo al que renuncio junto con Calderón en 2005.
Asumió entonces el cargo de coordinador general de la precampaña de Felipe Calderón por la candidadura del PAN a la Presidencia de la República, luego Coordinador general de la campaña ya con Calderón como candidato, en marzo de 2005 cedió su lugar a Josefina Vázquez Mota y quedó como Vicecoordinador, en un ajuste de la estrategias de campaña realizado por el candidato. Tras la declaratora de Calderón como Presidente electo fue desginado Coordinador General del equipo de transición y apartir del 1 de diciembre de 2006 ocupó el cargo de Jefe de la Oficina de la Presidencia.
Se ha mencionado su probable relación con la empresa Oceanografía, contratista de Petróleos Mexicanos investigada por accidentes, sin que se haya comprobado algún vínculo.[8]
El 16 de enero de 2008 el presidente Felipe Calderón Hinojosa lo nombró Secretario de Gobernación en sustitución de Francisco Ramírez Acuña, cesando en el cargo de Jefe de la Oficina de la Presidencia.[2
